Идентификация сортообразцов чеснока озимого (Allium sativum L.) с использованием микросателлитных маркеров
Аннотация
В статье изложены результаты молекулярного анализа по идентификации сортообразцов чеснока озимого, отобранных из различных районов и областей Беларуси. Использованы 17 микросателлитных локусов для выявления генетического полиморфизма среди 54 селекционных образцов чеснока озимого (Allium sativum L.). В результате амплификации с микросателлитными локусами было получено 115 аллелей, с 6,7 аллели на локус в среднем. По результатам проведенного исследования выявлено генетическое разнообразие между сортообразцами, которые были распределены по 10 кластерам. Выявлены различия по генотипу чеснока озимого как между сортообразцами, так и пунктами, в которых проводили отбор.
Об авторах
И. Г. Кохтенкова
Белорусская государственная сельскохозяйственная академия
Беларусь
Беларусь
доктор с.- х. наук
В. В. Скорина
Белорусская государственная сельскохозяйственная академия
Беларусь
Беларусь
доктор с.- х. наук
А. С. Домблидес
Федеральный научный центр овощеводства
Россия
Россия
доктор с.-х. наук
Список литературы
1. Киселева, А. В. Хромосомная организация центромерных ретротранспозонов семейства TY3/GYPSY у Allium cepa L. и Allium fistulosum L. / А. В. Киселева, И. В. Киров, Л. И. Хрусталева // Генетика. – 2014. – Т. 50, № 6. – С. 670–676.
2. Чесноков, Ю. В. Оценка меры информационного полиморфизма генетического разнообразия / Ю. В. Чесноков, А. М. Артемьева // Сельскохозяйственная биология. – 2015. – № 50 (5). – С. 571–578.
3. Al-Zahim, M. Classification of genetic variation in garlic (Allium sativum L.) revealed by RAPD / M.Al-Zahim, H. J. Newbury, B. V. FordLloyd // Hort Science. – 1997. – Vol. 32 (6). – P. 1102–1104.
4. Bozzini, A. Discovery of Italian fertile tetraploid line of garlic / A. Bozzini // Econ. Bot. – 1991. – № 45. – P. 436–438.
5. Analysis of the genetic diversity of garlic (Allium sativum L.) by simple sequence repeat and inter simple sequence repeat analysis and agro-morphological traits / S. Chen [et аl.] // Biochem Syst Ecol. – 2014. – Vol. 55. – P. 260–267.
6. Analysis of the genetic diversity of garlic (Allium sativum L.) germplasm by SRAP / S. Chen [et аl.] // Biochem Syst Ecol. – 2013. – Vol. 50. – P. 139–146.
7. New microsatellite markers for garlic, Allium sativum (Alliaceae) / C. P. Cunha [et аl.] // Am. J. Bot. – 2012. – Vol. 99 (1). – P. 17–19.
8. Dice, L. R. Measures of the amount of ecologic association between species / L. R. Dice // Ecology. – 1945. – Vol. 26. – P. 297–302.
9. A review of microsatellite markers and their applications in rice breeding programs to improve blast diseaseresistance / M. Gous [et аl.] // Int. J. Mol. Sci. – 2013. – Vol. 14. – P. 22499–22528.
10. Ipek, M. Rapid characterization of garlic clones with locus-specific DNA markers / M. Ipek, A. Ipek, P. W. Simon // Turk. J. Agric. For. – 2008. – Vol. 32. – P. 357–362.
11. Ipek, M. Molecular characterization of Kastamonu garlic: an economically important garlic clone in Turkey / M. Ipek, A. Ipek, P. W. Simon // Sci Hortic. – 2008. – Vol. 115 (2). – P. 203–208.
12. Development and validation of new SSR markers from expressed regions in the garlic genome / M. Ipek [et аl.] // Scientia Agricola. – 2015. – Vol. 72 (1). – P. 41–46.
13. Inter simple sequence repeat fingerprints for assess genetic diversity of Tunisian garlic populations / N. Jabbes [et аl.] // J. Agric. Sci. – 2011. – Vol. 3. – P. 77–85.
14. Classification of genetic variation in garlic (Allium sativum L.) using SSR markers / M. Jo [et аl.] // Aust. J. Crop Sci. – 2012. – Vol. 6. – P. 625–631.
15. Classification of genetic variation in garlic (Allium sativum L) using SSR markers / M. H. Jo [et аl.] // AJCS. – 2012. – Vol. 6 (4). – P. 625–631.
16. Lampasona, S. G. Genetic diversity among selected Argentinean garlic clones (Allium sativum L.) using AFLP (Amplified Fragment Length Polymorphism) / S. G. Lampasona, L. Martínez, J. L. Burba // Euphytica. – 2003. – Vol. 132 (1). – P. 115–119.
17. Cross-amplification of SSR markers developed from Allium sativum to other Allium species / G. A. Lee [et аl.] // Sci Hortic. – 2011. – Vol. 128. – P. 401–407.
18. Isolation and characteristics of eight novel polymorphic microsatellite loci from the genome of garlic (Allium sativum L.) / K. H. Ma [et al.] // Sci Hortic. – 2009. – Vol. 122. – P. 355–361.
19. Ohri, D. Phenology and genome size variation in Allium L. – a tight correlation / D. Ohri, K. Pistrick // Plant Biol. – 2001. – Vol. 3. – P. 654–660.
20. Pearce, S. R. The Ty1-copia group retrotransposons of Allium cepa are distributed throughout the chromosomes but are enriched in the terminal heterochromatin / S. R. Pearce, U. Pich, G. Harrison // Chrom. Res. – 1996. – Vol. 4. – P. 357–364.
21. Perrier, X. Data analysis methods / X. Perrier, A. Flori, F. Bonnot // Genetic diversity of cultivated tropical plants / eds.: P. Hamon, M. Seguin, X. Perrier, J. C. Glaszmann. – Enfield, 2003. – P. 43–76.
22. Evolution of genome size across some cultivated Allium species / A. Ricroch [et al.] // Genome. – 2005. – Vol. 48. – P. 511–520.
23. Genetic structure and eco-geographical adaptation of garlic landraces (Allium sativum L.) in Iran / S. Shaaf [et al.] // Genet. Res. Crop. – 2014. – Vol. 61. – P. 1565–1580.
24. BAC FISH analysis in Allium cepa / G. Suzuki [et al.] // Genes and Genetic Systems. – 2001. – Vol. 76. – P. 251–255.
25. Volk, G. M. Genetic diversity among US garlic clones as detected using AFLP methods / G. M. Volk, A. D. Henk, C. M. Richards // JASHS. – 2004. – Vol. 129 (4). – P. 559–569.
26. Molecular genetic diversity and population structure of a selected core set in garlic and its relatives using novel SSR markers / W. G. Zhao [et al.] // Plant Breed. – 2011. – Vol. 130. – P. 46–54.
Рецензия
Для цитирования:
Кохтенкова И.Г., Скорина В.В., Домблидес А.С. Идентификация сортообразцов чеснока озимого (Allium sativum L.) с использованием микросателлитных маркеров. Земледелие и растениеводство. 2021;(3):44-48.
For citation:
Kokhtenkova I.G., Skorina V.V., Domblides A.S. Identification of winter garlic (Allium sativum L.) varieties using microsatellite markers. Сrop Farming and Plant Growing. 2021;(3):44-48. (In Russ.)
Просмотров: 84
Послать статью по эл. почте 